《四库全书总目》共收录清乾隆以前的历代书籍一万零二百五十四种，十七万二千八百六十卷。其中收入《四库全书》之书三千四百六十一种，七万九千三百零九 卷，另附《存目》著录未收入《四库全书》的“寻常著述”一万零二百五十四种，十七万二千八百六十卷。这些书籍都按清政府的政治标准经过严格而反复的甄审， 凡认为有违碍内容的一概摒弃剔除在外。《总目》按经、史、子、集分为四部，下分四十四类，类下应细分者则分属。
各部首有总叙，叙各部学术源流变迁。每类前有小序，记类别沿革，学派推移。各属之末附列案语，说明立类原由及标准。每类先列《四库全书》 收入书，次为《存目》书。每书在书名、卷数下注所据版本，记明系某官采进本，或内府藏本、《永乐大典》本、某刊本、通行本等。然后是此书提要。
【经部】
十三经 《孟子》《仪礼》《周礼》《礼记》《尚书》《诗经》《周易》《孝经》《论语》《尔雅》《春秋左传》《春秋公羊传》《春秋谷梁传》
十三经注疏 《仪礼注疏》《孟子集注》《论语集注》《尔雅注疏》《孝经注疏》《春秋公羊传注疏》《孟子注疏》《论语注疏》《周易正义》《春秋左传正义》《春秋谷梁传注疏》《周礼注疏》《礼记正义》《尚书正义》
经学其他 《中论》《大学章句》《大学章句集注》《中庸章句》《中庸章句集注》《周易参同契》《易传》《释名》《孟子字义疏证》《东坡易传》《韩诗外传》《大戴礼记》《深衣考误》《輶轩使者绝代语释别国方言》《泰泉乡礼》《子夏易传》《周易郑康成注》《新本郑氏周易》《陆氏易解》《周易注》《周易略例》《周易集解》《易童子问》《毛诗》《尚书大传》《四书章句集注》
【史部】
正史 《三家注史记》《汉书》《后汉书 李贤注》《后汉书》《三国志 裴松之注》《晋书》《宋书》《南齐书》《梁书》《陈书》《魏书》《北齐书》《周书》《北史》《南史》《隋书》《旧唐书》《新唐书》《旧五代史》《新五代史》《宋史》《辽史》《金史》《元史》《明史》《清史稿》《新元史》《史记》《汉书 颜师古注》《后汉书 李贤注》《晋书》《宋书》《南齐书》《梁书》《陈书》《魏书》《北齐书》《周书》《北史》《南史》《隋书》《旧唐书》《新唐书》《三国志 裴松之注》《旧五代史》《新五代史》《宋史》《辽史》《金史》《元史》《明史》
编年 《资治通鉴》《资治通鑑》《续资治通鉴》《续资治通鉴长编》《续资治通鉴长编拾补》《资治通鉴全译》《***史事日志》《大唐创业起居注》《众家编年体晋史》《后汉纪校注》《汉官六种》《前汉纪》《今本竹书纪年疏证》《古本竹书纪年辑证》《西夏书事》《前汉纪》《竹书纪年》《廿二史札记》
野史 《穆天子传》《南明野史》《夏商野史》《秦朝野史》《西汉野史》《隋唐野史》《元代野史》《留东外史》《留东外史续集》《民国野史》《朝野佥载》《大金吊伐录》《大宋宣和遗事》《大唐创业起居注》《大唐新语》《大同纪事》《东南纪事》《皇明本纪》《皇明纪略》《皇明奇事述》《皇明盛事述》《皇明异典述》《江南野史》《靖康传信录》《靖康纪闻》《九州春秋》《康雍乾间文字之狱》《辽志》《满清外史》《满清兴亡史》《明皇杂录》《南迁录》《南北朝杂记》《南岳小录》《南征录汇》《奴才小史》《清朝前纪》《清代野记》《清宫禁二年记》《清暑笔谈》《三国杂事》《十六国春秋别本》《十叶野闻》《蜀王本纪》《宋朝事实》《隋唐嘉话》《太平天国战记》《唐国史补》《外交小史》《万历野获编》《魏晋世语》《五代春秋》《五代史阙文》《五代新说》《五国故事》《西夏事略》《西夏书事》《西巡回銮始末》《熙朝新语》《献帝春秋》《湘军志》《湘山野录》《鸦片事略》《野记》《云中纪变》《云中事记》《张文襄公事略》《江阴城守纪》《扬州十日记》《乙酉扬州城守纪略》
别杂史 《大业拾遗记》《隋唐嘉话》《晋后略》《文献通考》《九州春秋》《满清入关***》《九家旧晋书辑本》《书湖州庄氏史狱》《庄氏史案》《扬州十日记》《五代新说》《奉天录》《逸周书》《明季南略》《贞观政要》《明季北略》《粤游见闻》《国闻备乘》《蜀乱述闻》《龙川别志》《顺宗实录》《十六国春秋别传》《战国策》《靖康传信录》《国语》《平宋录》《八家后汉书辑注》《松漠纪闻》《东观汉记校注》《五代史阙文》《东观奏记》《晏子春秋》《博物志》《南明野史》《十六国春秋》《营造法式》《元朝秘史》
史评 《读通鉴论》《三国杂事》《史通》《宋论》《文史通义》
传记 《廿二史札记》《魏郑公谏录》《英雄记》《晏子春秋集释》《纳兰家族墓碑》《浙东纪略》《汉魏南北朝墓志汇编》《过江七事》《明儒学案》《唐才子传》《列女传》《西使记》
载记 《万历野获编》《律条公案》《三国遗事》《华阳国志校补图注》《越绝书》《吴越春秋》《江南野史》《五国故事》
地理 《佛国记》《吴船录》《水经注》《蛮书》《台湾通史》《岁华纪丽谱》《庐山记》《桂林风土记》《南岳小录》《北户录》《寺塔记》《淳熙三山志》《大唐西域记》《三辅黄图》《洛阳伽蓝记》《读史方舆纪要》《荆楚岁时记》《岛夷志略》《吴地记》《岭表录异》《都城纪胜》《武林旧事》《梦粱录》《东京梦华录》《岭外代答》
职官 《天朝田亩制度》《郭店楚墓竹简》《从政录》《官箴》《唐六典》《三朝北盟会编》
政书 《中国官场学》《学治臆说》《明太祖宝训》《刘壮肃公奏议》《唐律疏议》《唐会要》《通典》《幕学举要》《宋朝事实》《枢垣记略》《佐治药言》《续佐治药言》
目录 《书目答问》《中国农业典籍目录》《常用古籍版本目录》《古籍目录及其功用》《古籍版本知识》《名家推荐的国学书目》《郡斋读书志》《四库全书总目提要》《崇文总目》
【子部】
儒家 《明夷待访录》《小学诗》《家范 (全译评点本)》《潜夫论笺校正》《二十四孝》《传习录》《南询录》《鉴略妥注》《盐铁论》《朱子语类》《小儿语》《申鉴》《张子正蒙》《训蒙骈句》《说苑》《声律启蒙》《西铭》《新序》《名贤集》《典论》《新书》《春秋繁露》《新论》《法言义疏》《荀子》《孔丛子》《孔子家语》《读书分年日程》《朱子治家格言》《北溪字义》《围炉夜话》《袁氏世范》《菜根谭》《新语(简繁对照)》《呻吟语摘》《陆贾新语注释》《知言》《中说》《近思录》《帝范》《论语(英译本)》《定州汉墓竹简《论语》》《春秋穀梁传注疏》《心经》《新语》
道家 《抱朴子内篇》《素书》《老子集注》《历代崇道记》《僧宝传》《亢仓子》《通玄真经》《庄子·内篇》《云笈七签》《太平经合校》《老子道德经校释》《列仙传》《列子》《道德经（老子）》《老子道德经(英译本)Lao Tze》《庄子》《黄帝阴符经》《庄子集释》《关尹子》《金人铭》《庄子集解》《文子》《无能子》《列子集释》《老子想尔注》《神仙传》《帛书《黄帝四经》》《抱朴子外篇》《金刚经集注》《太上感应篇》《无量寿经》
法家 《韩非子》《申子》《商君书》《邓子》《管子》《管子轻重篇新诠》《扬子法言》《折狱龟鉴》《棠阴比事》《邓析子》
释家 《佛祖通载》《释氏稽古略》《五灯会元》《林间录》《宋高僧传》《了凡四训》《开元释教录》《古尊宿语录》《法苑珠林》《六祖大师法宝坛经》《弘明集》《佛说四十二章经》《广弘明集》《碧岩录》《罗湖野录》
兵家 《鬼谷子》《司马法》《孙子略解》《尉缭子》《兵制》《孙膑兵法》《太白阴经》《将苑》《历代兵制》《孙子兵法》《百战奇略》《乾坤大略》《吴子》《握奇经》《墨子城守各篇简注》《三略》《何博士备论》《六韬(注释本)》《三十六计》《唐李问对》《言兵事疏》《守城录》《翠微北征录》《虎钤经》《投笔肤谈》《武经总要》《十七史百将传》《练兵实纪》《武侯八阵兵法辑略》《翠微先生北征录》《六韬》
农家 《氾胜之书》《农学古籍概览》《天工开物》《禾谱》《齐民要术》
杂家 《物不迁论》《化书》《不真空论》《淮南子》《人物志》《吕氏春秋》《七修类稿》《鹖冠子》《封氏闻见记》《慎子》《风俗通义校注》《尹文子》《论衡》《墨子闲诂》《梦溪笔谈》《兼明书》《墨子》《厚黑学》《颜氏家训集解》《两同书》《颜氏家训》《刘子》《仇池笔记》《公孙龙子》《金楼子》《麈史》《智囊全集》《白虎通义》《分甘馀话》《爱日斋丛抄》《容斋随笔》《鹤林玉露》《居易录》《齐东野语》《敬斋古今黈》《寓简》《日知录》《冷斋夜话》《中华古今注》《长短经（反经）》《言行龟鉴》《东坡志林》《神异经》《五杂俎》《池北偶谈》《板桥杂记》《夜航船》《容斋续笔》《西征随笔》《谐铎》《清代名人轶事》《笑林广记》《甲申朝事小纪》《日闻录》《明季三朝野史》《勤有堂随录》《永历实录》《墨子白话今译》《清代野记》《清稗琐缀》《南越笔记》《鬼谷子本经阴符七术》《长短经》《忍经》《拾遗记》《忠经》《世说新语》《老学庵笔记》
术数 《青囊奥语》《撼龙经》《灵城精义》《三命通会》《葬书》《月波洞中记》《天玉经》《宅经》《太玄经》
医家 《伤寒论》《古方八阵》《金匮要略》《黄帝内经》《备急千金要方》《灵枢》《景岳全书》《素问》《血证论》《神农本草经》《濒湖脉学》《医学三字经》《难经》《洗冤集录》《傅青主女科》《痧胀玉衡》《颅囟经》《药性赋》《本草纲目》《温热论》《脉经》《千金翼方》《类证治裁》《脉象口诀歌》《医方集解》《中医内科方剂索引》《医学源流论》《铜人针灸经》《褚氏遗书》《奇经八脉考》《针邪密要》《鬼门十三针》
科技 《九章算术》《周髀算经》《孙子算经》《缉古算经》《算学启蒙总括》
艺术 《画继》《林泉高致集》《棋经论》《笠翁对韵》《象棋十诀》《棋经》《桔中秘叙》《书断列传》《梅花谱》《古画品录》《象棋指归》《棋经十三篇》《扬州画舫录》《益州名画录》《画禅室随笔》《乐府杂录》《酒经》
书画 《六体书论》《评书药石论（含今译）》《法书论》《授笔要说》《送高闲上人序》《笔阵图》《二字诀》《与梁武帝论书启》《草书势》《隶书体》《论书表》《四体书势》《草书势(含今译)》《论书》《非草书》《奴书订》《笔意赞》《六书缘起》《评书》《采古来能书人名》《书后品》《海岳名言》《临池诀》《书旨述》《翰墨志》《论书》《笔髓论》《钝吟书要[节录]》《书述》《法书论》《题跋176则》《试笔》《书品[节录]》《续书断》《论书表》《衍极并注》《论书》《书学》《翰林要诀》《论书》《作字示儿孙》《春雨杂述》《负暄野录》《散论》《书诀》《书法雅言》《书学捷要[节录]》《论法书》《南北书派论[节录]》《书法约言》《书筏》《北碑南帖论[节录]》《书论》《承晋斋积闻录》《古今书评》《清人原著——书法秘诀》《艺概[节录]》《题卫夫人笔阵图后》《书法辑要》《广艺舟双楫》《五十六种书并序》《临池管见》《书法散论》《艺舟双辑（附《十七帖》疏证）》《述张长史笔法十二意》《九势》《用笔法》《论用笔十法》《释怀素与颜真卿论草书》《续书谱》《论书》《法书要录-六卷全》《书断》《书法论》《书论》《孙过庭书谱及其释文》《图画见闻志》
谱录 《茶录》《茶疏》《煮泉小品》《阳羡茗壶系》《茶经(今注)》《茶经》《随园食单》《北山酒经》《橘录》《古今刀剑录》《岕茶汇抄》《北苑别录》《洛阳牡丹记》《大明水记》《宣和北苑贡茶录》《禽经》《东茶记》《茶赋 幷书》《茶神传》《十六汤品》《东茶颂》《茶谱》《唐人咏茶诗》《茶录》《刘氏菊谱》《大观茶论》《宣和北苑贡茶录》《北苑别录》《茶谱》
类书 《说文解字》《艺文类聚》《初学记》《太平御览》
蒙学 《幼学琼林》《弟子规》《三字经》《增广贤文》《千字文》《龙文鞭影》《百家姓》《朱子家训》
【集部】
总集 《唐文续拾》《全齐文》《唐文拾遗》《全宋文》《敦煌变文集新书》《全唐文》《全晋文》《千家诗》《先唐文》《全三国文》《宋诗一百首》《全隋文》《全后汉文》《唐诗三百首》《全后周文》《全汉文》《薛涛、李冶诗集》《全北齐文》《全秦文》《箧中集》《全后魏文》《全上古三代文》《全唐诗》《全陈文》《十八家诗抄》《乐府诗集》《全梁文》《古诗源》《昭明文选》《全汉诗》《古文观止》《文忠集》《先秦汉魏晋南北朝诗》《诗 (历代诸家)》《词曲(历代诸家)》《文(历代诸家)》《古谣谚》《楚辞章句疏证》《元诗别裁集》《清诗别裁集》《全唐五代词》《宋词三百首》《牡丹亭》《六朝文絜》《文选》
别集 《嵇康诗全集》《阮籍诗全集》《双江聂先生文集》《刘桢诗全集》《王心斋全集》《陈琳诗全集》《王文成全书》《王粲诗全集》《竹斋集》《曹丕诗全集》《铁崖乐府》《苏轼词选（４８首)》《谢朓全集》《陆游诗全集》《己亥杂诗》《谢灵运诗全集》《栾城集》《曾国藩家书》《陶渊明诗全集》《周子全书》《曾国藩文集》《罗昭谏集》《孟郊集》《陶庵梦忆》《李义山诗集》《寒山子诗集》《明圣二湖》《曹操诗集》《苏洵集》《叙陈正甫会心集》《西湖梦寻》《前赤壁赋》《借竹楼记》《陈情表》《醉翁亭记》《童心说》《归去来辞》《爱莲说》《养兰说》《秋兴赋并序》《读孟尝君传》《高洁说》《长门赋》《藤王阁序》《杂说》《归田赋》《吊古战场文》《与袁石浦》《徐霞客游记》《小石潭记》《寒花葬志》《送董生邵南序》《诫子篇》《林纾作品集》《师说》《与山巨源绝交书》《登楼赋》《李斯谏逐客书》《思旧赋并序》《崔颢诗全集》《愚公移山》《酒德颂》《陈子昂诗集》《后出师表》《崔护诗选》《李贺诗全集》《前出师表》《白居易诗全集》《岑参诗选》《桃花源记》《薛涛诗全集》《杜甫诗全集》《兰亭集序》《李白诗全集》《王维诗集》《洛神赋》《九歌》《李商隐诗选》《闲情赋并序》《曹操诗全集》《杜审言诗全集》《古诗十九首》《离骚》《苏武李陵诗》《晋王右军集》《孔雀东南飞》《岑参集》《鲍明远集》《郴江百咏》《粤词雅》《范德机诗集》《陶渊明集》《宋袁阳源集》《林和靖集》《玉台新咏》《晋荀公曾集》《真山民集》《临川先生文集》《晋孙子荆集》《侨吴集》
楚辞 《楚辞补注》《楚辞》《文心雕龙译注》
词 《曹组词集》《饮水词》《范成大词集》《茶联集锦》《断肠词》《平水韵部》《梅溪词》《词韵简编》《竹斋诗余》《词格律》《竹屋痴语》《婉约词》《龙洲词》《白朴集》《姜夔词选》《蒲江词》《白石道人歌曲》《漱玉词》《知稼翁词》《平斋词》《无住词》《樵隐词》《酒边词》《片玉词》《稼轩词》《坦菴词》《溪堂词》《归愚词》《东堂词》《审斋词》《筠豀乐府》《姑溪词》《丹阳词》《海野词》《小山词》《逃禅词》《石林词》《淮海词》《东浦词》《山谷词》《圣求词》《芦川词》《东坡词》《和清真词》《六一词》《友古词》《柳永词全集》《安陆集》《乐章集》《珠玉词》《全宋词》《李煜词全集》《听秋声馆词话》《白香词谱》《唐宋名家词选》
诗文评 《诗人玉屑》《复雅歌词》《诗学禁脔》《词论》《木天禁语》《沧浪诗话》《山房随笔》《石林诗话》《诗法家数》《白石道人诗说》《后山诗话》《乐府指迷》《二老堂诗话》《苕溪渔隐丛话前集》《温公续诗话》《拙轩词话》《苕溪渔隐丛话后集》《唐子西文录》《时贤本事曲子集》《紫微诗话》《彦周诗话》《浩然斋词话》《中山诗话》《诗式》《四溟诗话》《风骚旨格》《诚斋诗话》《国雅品》《续诗品》《观林诗话》《艺苑卮言》《姜斋诗话》《庚溪诗话》《答万季埜诗问》《诗镜总论》《藏海诗话》《钝吟杂录》《麓堂诗话》《优古堂诗话》《南濠诗话》《升庵诗话》《六一诗话》《逸老堂诗话》《诗谱》《文笔要诀》《归田诗话》《吴礼部诗话》《诗人主客图》《梅磵诗话》《乐府古题要解》《诗品》《杜工部草堂诗话》《二十四诗品》《东坡诗话》《人间词话》《文心雕龙》《诗学源流考》《文心雕龙考异》《赌棋山庄词话》《解人颐》
曲 《包待制智勘后庭花》《雷峰塔》《元人小令选》《娇红记》《无名氏28首》《精忠旗》《张可九元曲集》《清忠谱》《窦娥冤》《汉宫秋》《梁山伯与祝英台》《包龙图智赚合同文字》《倩女离魂》《包待制智赚生金阁》《西厢记》《桃花扇》《长生殿》《全元曲》
小说 《水浒传》《红楼梦》《三国演义》《西游记》《镜花缘》《说唐》《初刻拍案惊奇》《常言道》《二刻拍案惊奇》《唐钟馗平鬼传》《警寤钟》《三刻拍案惊奇》《胡涂世界》《斯文变相》《戏中戏》《梼杌萃编》《廿年繁华梦》《负曝闲谈》《醋葫芦》《医界镜》《杜骗新书》《文明小史》《扫迷帚》《善恶图全传》《姜氏秘史》《无耻奴》《通天乐》《两晋秘史》《冷眼观》《商界现形记》《南朝秘史》《中山狼传》《上古秘史》《斩鬼传》《东汉秘史》《夏商野史》《皇清秘史》《西施艳史演》《贵妃艳史演义》《神魔列国志》《清代宫廷艳史》《洪宪宫闱艳史演义》《仙杂记》《明代宫闱史》《西太后艳史演义》《金瓶梅》《宋代十八朝艳史演义》《武瞾传》《杨家将传》《宋代宫闱史》《隋炀帝艳史》《儒林外史》《唐代宫廷艳史》《貂蝉艳史演义》《聊斋志异》《隋代宫闱史》《双凤奇缘》《警世通言》《汉代宫廷艳史》《醒世恒言》《昭君艳史演义》《周朝秘史》《喻世明言》《封神演义》《老残游记续集》《老残游记》《官场现形记》《水浒后传》《西游记传》《好逑传》《飞龙全传》《平山冷燕》《南游记》《儿女英雄传》《北游记》《花月痕》《张文祥刺马案》《禅真逸史》《绿野仙踪》《合锦回文传》《禅真后史》《仙侠五花剑》《三侠五义》《南海观音菩萨出身修行传》《济公全传》《小五义》《观音菩萨传奇》《山海经》《续小五义》《韩湘子全传》《牛郎织女传》《七剑十三侠》《女仙外史》《东游记》《八仙得道》《绣云阁》《鬼神传》《东周列国志》《二十四尊得道罗汉传》《五美缘全传》
《总目》的提要内容特点之一是“主于考订异同，别白得失，故辨驳之文为多”。“先列作者之爵里”，“次考本书之得失，权众说之异同”。于“文字增删、篇 帙分合，皆评为订辨”。对久已定论的书籍，“但论其刊刻传写之异同，编次增删之始末，著是本之善否”。对有些古籍的考订在一定程度上吸收了当时的研究成 果，订正了前人的缺失。特点之二是对书籍的评价以“阐圣学，明王道”为主，突出宣传封建正统思想的政治观点，掊击屏斥“离经叛道”的异端思想。对“人品学 才之醇疵，国纪朝章之法戒”，“各昭彰瘅，用著劝惩”。
《四库全书总目》是一部空前的超大型综合性解题目录。虽然因政治原因，一批有价值的书籍被摒弃在外，但仍基本上包括了清乾隆以前中国古代的重要著作 (尤以元代以前的书籍收辑更为完备)，还有从《永乐大典》中辑出的三百八十五种已佚古籍，从篇帙上讲是独一无二的目录学巨著。而且它有充实的内容提要，系统的分类编排的总序小序，体制完备，对我国十八世纪以前学术是一次经典性的总结，对后人阅读图书起着重要的指导作用，不少学者就是以《总目》为“读书门径”走上治学道路的。直到今天，仍有重要的参考价值。
《四库全书总目》继承和发展了我国传统目录的方法和形式，在目录学史上具有重要的学术意义和影响。首先，《总目》在传统四部分类法的基础上，充分吸取各种书目的分类优点，并根据图书和学术发展的现实需要，制订出一系列类目及立类的原则，形成了相当完整的分类体系。在《总目》刊布之前，各种目录，尤其是私人藏书目录的分类和编排是极其紊乱的， 《总目》刊布后，很快的就都按照它的分类体系去做了，以后虽有修改补充，但无重大突破。直到今天，仍是古书编目分类的基本法则。第二，《总目》总结了刘向以来，特别是宋代公私藏书目录编写提要的方式方法，也汲取了清代读书题跋记的方法和形式，从而形成了一种新的反映图书版本、文字和内容，并结合当时政治需 要，宣传封建思想的提要形式。对清后期目录提要的编纂，特别是藏书志的产生和发展起了很大影响。另外，由于《总目》的博大及其在收书、著录、考订等方面存在着种种缺点和谬误，引起了目录学家的研 究兴趣，产生了一系列为《总目》纠缪补阙的目录著作，如阮元《四库未收书提要》、姚觐元《清代禁毁书目》、邵懿辰《四库简明目录标注》、余嘉锡《四库提要 辨证》、胡玉缙《四库全书总目提要补正》等，从而开辟了目录学研究的一个新领域。
《总目》在目录学上的成就和意义，“就其大体言之，可谓自刘向《别 录》以来，才有此书”。它的典型作用，推动了各种目录的迅速发展，不但使我国封建社会末期的目录事业为之一振，就是对近代目录学发展也有着极其深远的影响。
乾隆五十八年(1793)武英殿首次刊印，简称殿本。乾隆六十年(1795)浙江在地方官(谢启昆、阮元)和士绅(沈青、鲍士恭)的合作下，据文澜阁藏殿本翻刻，校正了殿本不少错误，简称浙本。后来的一切版本都是从这两种刻本翻印的。同治七年(1868)广东书局以浙本为底本 复刻，个别字句据殿本校改，简称粤本。1964年中华书局用浙本作底本，参用殿本和粤本相校，作校记附后，由王伯祥先生断句，排印出版。后附《四库撤毁书 提要》、《四库未收书提要》，以及书名、著者姓名索引。2019年国家图书馆出版社据天津图书馆藏清武英殿本出版有国学基本典籍丛刊之《武英殿本四库全书总目》。
